Ankara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü 21 Temmuz 2010 tarihli ve 2748 sayılı karar ile kurulmuştur. Enstitü Yönetimi ve hizmeti Ankara Yıldırım Beyazıt Üniversitesinin Etlik Milli İrade yerleşkesinde yürütülmektedir.
Enstitümüzde Tıp, Sağlık Bilimleri, Spor Bilimleri ve Disiplinler arası Anabilim Dallarında Tezli ve Tezsiz Yüksek Lisans ile Doktora programlarında Eğitim-Öğretim yürütülmektedir. Eğitim dili Türkçe olmasının yanı sıra bazı disiplinlerde ise İngilizce Lisansüstü Eğitim-Öğretim İmkânı Vardır.
Enstitümüz bünyesinde 32 anabilim dalı ve 76 program aktif olarak lisansüstü eğitim faaliyetlerine devam etmektedir. 2025-2026 eğitim öğretim yılı itibarıyla bu programlarda 106 tezsiz yüksek lisans, 334 tezli yüksek lisans ve 217 doktora olmak üzere 657 lisansüstü öğrenci bulunmaktadır. Enstitümüz bünyesindeki lisansüstü programlardan 699 tezsiz yüksek lisans, 720 tezli yüksek lisans ve 182 doktora olmak üzere toplam 1601 öğrenci mezun olmuştur.
Lisansüstü Eğitimde çalışma ortamlarını; Bilkent Kampüsündeki Tıp Fakültesi Araştırma Laboratuvarı, Etlik Kampüsündeki Merkezi Araştırma Laboratuvarlarının yansıra çeşitli Kamu Kuruluşlarının imkânları oluşmaktadır.
Enstitümüz Öğrenci alımlarını genellikle her yılın güz dönemi öncesinde gerçekleştirmektedir.